Damit das Update mit dem Updater klappt, muss über das Terminal folgendes eingestellt sein:
sudo chown www-data:www-data /var/www
Nachdem der Updater fertig ist und „Start update“ anbietet, sollte (bei vielen und großen Dateien) dieser Prozess auch lieber direkt vom Terminal gestartet werden. Dafür muss die Datei occ ausführbar eingestellt werden. Also:
sudo su
chmod +x occ
exit
sudo -u www-data ./occ upgrade
Fertig.
Vorher noch ein Backup machen:
sudo cp -R /DEIN_PFAD_ZU_OWNCLOUD/ /DEIN_BACKUP_PFAD/